为适应国家网络空间安全的重大战略，发展和建设高质量、多层次网络空间安全科研人才队伍，东南大学将信息与通信工程、计算机科学与技术和数学等3个一级学科的相关资源集成，积极开展网络空间安全的人才培养与科学研究，2016年获得首批网络空间安全一级学科博士授权点，成立了以于全院士为名誉院长、张广军院士为兼职院长的网络空间安全学院，获江苏省“十三五”重点学科，中期检查结果为“优秀”。
2017年9月获批中央网信办、教育部“一流网络安全学院建设示范项目高校”;2019年6月通过中央网信办、教育部第一次评估。2018年3月，“网络空间安全”本科专业通过教育部审批;2019年12月入选首批教育部一流本科专业建设“双万计划”。2018年7月，获批国家互联网信息办公室、教育部“网络空间国际治理研究基地”。2019年9月获批“网络空间安全”博士后流动站。
学院现有专兼职教师150人，其中研究生导师132人。院内专任教师教授、副教授比例 62.5%，博士比例95%，45岁以下比例 72.5%。在学院专兼职教师中，有中国工程院院士7人、国家网络安全优秀教师3人。
已经建立了本科生、硕士生、博士生、博士后完整的人才培养体系，遵循网络安全人才培养规律，创新人才培养机制，努力培养网络安全领军人才。强化实践实训和创新能力培养，2019年学生各类网安竞赛20场，获奖超过30项，其中全国“互联网+”大学生创新创业大赛中获1项金奖、1项银奖;第十二届全国信息安全竞赛作品赛中获2项一等奖、3项二等奖，创新实践能力赛1项一等奖等。
学院通过强化原始创新、强化战略布局、强化协同组织、强化制度保障，着力全面深化科技体制改革，构建“一体两翼”科研格局，努力做有学术穿透力的科研。学院建有江苏省计算机网络技术重点实验室、CERNET华东北地区网络中心，并与信息学院、计算机学院共建移动通信国家重点实验室、国家“2011计划”无线通信技术协同创新中心、计算机网络和信息集成教育部重点实验室等科研基地。学院以于全院士首席科学家为学科带头人，在芯片安全、无线通信网安全、计算机网络安全、内容安全、网络空间治理等5大特色研究方向上实现基础理论突破和实践创新。推进和紫金山实验室、无锡市、中国电子、南瑞集团、中科芯等开展产学研合作。
